Xaira Therapeutics 推出全球最大 Perturb-seq 数据集 X-Atlas/Orion，加速生物人工智能研究和药物开发

Xaira Therapeutics在近日宣布了其在开发AI驱动的虚拟细胞模型方面取得的重大突破，发布了名为“X-Atlas/Orion”的迄今最大规模公开Perturb-seq基因图谱数据集。该数据集的发布得益于Xaira新推出的“Fix-Cryopreserve-ScRNAseq”（FiCS）Perturb-seq平台，这一平台具备高灵敏度、可扩展性和重复性，能够高效生成大规模高质量的基因扰动数据。X-Atlas/Orion数据集包含了800万个细胞，覆盖所有人类蛋白质编码基因，并进行了超过16,000个独特分子标识符（UMIs）的深度测序，使得研究人员可以从广泛的基因扰动中发现生物表型。 Xaira Therapeutics通过FiCS平台解决了大规模细胞分析中的物流难题，不仅有效捕捉了基因扰动诱导的转录组变化，还准确重现了已知的生物路径和蛋白复合体。这项技术的最大亮点在于能够检测剂量依赖性的基因效应，这意味着可以通过测量每个细胞中的单导向RNA（sgRNA）水平来精确评估基因被抑制的程度。这不同于传统方法将基因敲低视为简单的“开”或“关”，FiCS平台的方法为理解基因功能提供了更加细致的框架，从而增强未来因果模型的预测能力和生物学见解。 此次发布的X-Atlas/Orion数据集和FiCS平台是Xaira自2024年4月成立以来取得的标志性成就之一。2024年10月，Xaira的联合创始人曹大卫博士与谷歌DeepMind的哈萨比斯和约翰·乔普博士一起获得了诺贝尔化学奖，理由是他们在利用AI预测蛋白质结构和设计新型蛋白质方面的开创性贡献。Xaira团队正在此基础上进一步推进模型的发展，同时研发新的方法，旨在将生物靶点和工程分子与疾病的临床表现连接起来，重新定义药物发现和开发的全过程。 博·王，Xaira Therapeutics的副总裁兼生物医学AI负责人表示：“这一平台提供的规模和质量对于模拟细胞在不同条件下的响应至关重要，是训练第一代虚拟细胞模型的关键步骤。有了这个基础，我们能更好地揭示疾病机制，设计更智能的治疗方案。”而希·楚，Xaira的早期发现副总裁兼此次预印本的高级作者也指出：“我们相信这将帮助我们更好地理解疾病生物学，发现新的药物靶点。” X-Atlas/Orion数据集现在已对外开放，可以在 figshare 平台上访问。此外，相关技术的预印本也在 bioRxiv 上发布，详细介绍了FiCS平台和数据集的生成过程及其潜在应用。 Xaira Therapeutics作为一家专注于人工智能和生物技术结合的集成生物技术公司，位于旧金山湾区，致力于通过跨领域的合作，重新定义药物发现和开发的过程。公司汇集了机器学习、大数据生成和治疗产品开发领域的顶尖人才，力求在理解生命本质和治疗疾病方面取得突破。